Leaf Village je u opasnosti još jednom, nakon Akatsuki odlučili koristiti svoj najmoćnije oružje - junaci ligi. Sva sela su branitelji išli u rat shinobi i jedina šansa za spas - Naruto. Dječak još uvijek ne zna mnogo, ali to je vrlo veliku snagu i potencijal u borbi. Upravljanje Naruto, kupiti oružje i boriti neprijatelja. Za svaki ubijeni ste dobili zlato koje se može provesti u kočiji na novu tehnologiju.