Steve, najpoznatiji stanovnik Minecrafta, dugo je gledao avanture slavnog surfera podzemne željeznice i njegova putovanja po svijetu. Progonila ga je pomisao da bi i to mogao učiniti, a zašto ne bi pokušao započeti vođenjem podzemne željeznice svog domaćeg svijeta obrtnika. Da biste stekli barem neku slavu u ovom sportu, morate se dokazati, potrebni su vam rekordi i pobjede. Pomozite junaku u Subway Runner 3D da postane konkurent poznatom trkaču i surferu. Steve će za sada samo trčati, skačući po automobilima, izbjegavajući sudare s raznim preprekama i skupljajući zlatnike. Cilj u Subway Runner 3D je postići što više bodova.