Jelly lik po imenu Misty kreće na putovanje kroz jedinstveni svijet platforme u MystiCloned. Njegov će put biti zanimljiv, ali prilično težak ako mu ne pomognete svladati prepreke. Za to će junaku trebati posebni portali. Prolazeći kroz njih, heroj će dobiti određeni broj klonova na raspolaganju. Izgledaju poput heroja, ali su obojeni u crno. Ako želite da se klon zaustavi na određenom mjestu, kliknite na njega tipkom miša i klon će postati blijedoružičast i ostati na mjestu. Ovo će biti potrebno kada trebate popraviti neki gumb za otvaranje vrata. U budućnosti ćete također morati koristiti klonove na različite načine kako biste prevladali razne prepreke u MystiClonedu.