Postalo je dobra tradicija da super heroji iz svemira Marvel izlaze sami protiv vojske čudovišta. U Batman Commanderu pomoći ćete Batmanu da odbije napade čudovišta iz svemira. Vrlo neugodna stvorenja, slična nevjerojatnim goblinima, napadat će i iz zraka i sa zemlje. Kako ne bi postao laka meta, junak će cijelo vrijeme biti u pokretu, odnosno trčati. U bijegu morate pucati na neprijatelje koji se kreću prema gore ili napadaju odozgo. Spretnost i spretnost se od vas traže. Zadatak je postići maksimalni broj bodova. Junak ima tri života, njihov se broj odražava u gornjem lijevom kutu. Kad se suočite s neprijateljem, jedan život nestaje u Batman Commanderu.