Runner igre su vrlo popularne i tko jednostavno nije trčao na virtualnim cestama, tračnicama i prugama podzemne željeznice. Igra Nano Ninjas poziva vas da trčite zajedno s malom nindžom. Odlučio je krenuti u lov na blago i čak je pronašao jedan drevni hram u kojem je mogao nabaviti stotinu nečega vrijednog. Ali kao rezultat toga, ne samo da može dobiti ništa, već i izgubiti život. Čim je zabio glavu u sljepoočnicu, u susret mu je iskočila ogromna crna pantera s namjerom da proždere uljeza. Vrijeme je da nindža poleti i vrijeme je da vi intervenirate i pomognete mu prevladati prepreke kako se ne bi pretvorio u večeru za zvijer u Nano Ninjama.