Na jednoj znanstvenoj stanici, katastrofa se dogodila u jednoj od planeta koje plutaju u orbiti. Znanstvenici su eksperimentirali s genima izvanzemaljaca, ali nešto je pošlo po zlu. Virus je pobjegao iz epruvete i pogodio mnoge ljude. Sada su se pretvorili u čudovišta i lutaju hodnicima baze. Vi u igri Alien Infestation FPS u momčadi vojnika bit će poslan na stanicu za uništenje čudovišta i spašavanje preživjelih. Morat ćete proći kroz hodnike stanice i koristiti svoje oružje da uništite sva čudovišta koja ćete susresti u odjeljcima baze.