Na jednom od udaljenih planeta svemirski istraživači otkrili su čudan labirint. Nestalo je nekoliko skupina znanstvenika koji su ušli u labirint. Vaš lik u igri Penetration je svemirski vojnik koji mora otići u labirint radi izviđanja. Vi ćete mu pomoći u njegovim avanturama. Ispred vas na ekranu ćete vidjeti određeno područje u kojem će vaš lik biti naoružan do zuba raznim oružjem. Koristeći kontrolne tipke, pokazat ćete u kojem smjeru će se vaš junak morati kretati. Kako se pokazalo, u labirintu žive razna bića koja će napasti vašeg heroja. Morat ćete koristiti oružje da ih sve uništite.