U dalekom divnom svijetu živi jedinstvena zmija čije se tijelo sastoji od mnogo lopti. Danas odlazi na putovanje, a u igri Snake Ball 3d pomoći ćete joj u tome. Vidjet ćete područje u kojem će se nalaziti vaša zmija. Puzat će naprijed postupno dobivajući brzinu. Na putu će je čekati razne prepreke. Pomoću kontrolnih tipki prisilit ćete zmiju da ih zaobiđe i izbjegne sudar s njima. Na putu će ponekad biti raznih predmeta i hrane. Morate to učiniti tako da ih zmija pojede. Tako ćete ga povećati i dobiti druge korisne bonuse.