Najčešće u igrama žanra letećih ptica morate pomoći jednoj ili drugoj ptici da prevlada teške dišne putove, leteći kroz uske praznine i pokušavajući ne udariti razne prepreke. U Flapi Smashu sve ćete raditi obrnuto. Zadatak je ne propustiti cijelo jato ptica koje se želi probiti kroz vašu stranicu. Da biste to učinili, upravljat ćete preprekama, zatvarajući ih svaki put kada ptica pokuša skliznuti u otvoreni prolaz. Same ptice su krive, objašnjeno im je da se ne isplati letjeti u ovom smjeru, ali iz nekog razloga to ne slušaju i sada krive sebe za Flapi Smash.