Tip po imenu Tom radi u kemijskom laboratoriju. Danas će naš junak proučavati strukturu molekula i provoditi razne eksperimente. Vi u novoj online igri IDLE Molecules sudjelujete u ovim eksperimentima. Ispred sebe na ekranu ćete vidjeti igralište na kojem ćete vidjeti molekule. Oni će biti međusobno povezani. Upravljačke ploče bit će vidljive s različitih strana. Na signal mjerača vremena počet ćete provoditi eksperimente. Da biste to učinili, vrlo brzo kliknite mišem na različite molekule. Svaki vaš klik donijet će vam određeni broj bodova. Na njima možete kupiti raznu opremu i instrumente za daljnja istraživanja.