Junakinja igrice Run Healthy osjeća se iscrpljeno i kašlje, što jasno ukazuje na početak prehlade. Kako se bolest ne bi razvila u ozbiljnije posljedice, mora se uništiti u korijenu. Zbog toga će započeti tzv. zdravo trčanje. Dok lagano trčite, vodite junakinju da skuplja zdravu hranu i izbjegava masne hamburgere. Ljestvica iznad djevojčine glave mora se napuniti kako bi im pružila dostojan otpor kada se susreću s virusima. Na ciljnoj liniji morate proći kroz nekoliko sprava za vježbanje: traka za trčanje, dizanje utega itd. Sve ovo radi poboljšanja zdravlja. Kao rezultat toga, djevojčica će postati vesela i potpuno zdrava u Run Healthy.
