Razvojem civilizacije čovječanstvo je počelo putovati kroz galaksiju i istraživati različite planete u potrazi za životom. Nakon što su otkrili naseljivu planetu, tamo su osnovali kolonije. No ono što se dogodilo bilo je očistiti mjesto za izgradnju zgrada. Vi ste u igri Subteralien i učinite to. Od vašeg broda do planeta shuttle se spušta i sleti u mjestu koje ste odabrali. Oko će biti razni objekti. Morate kliknuti mišem kako bi ih usmjerili i otvorili vatru s raketama. Oni će eksplodirati i uništiti sve predmete. Ljestvica oštećenja vidjet će se odozgo. Kada je napunjen, prijeći ćete na sljedeću razinu.
