U dalekom svijetu gdje magija postoji, postoji rat između dviju zemalja. Inteligentni zmajevi u njemu sudjeluju s obje strane. Danas ćete u igri Bakugan Armored Alliance sudjelovati u ovom sučeljavanju i kontrolirati jednog od zmajeva. Vaš će junak morati preletjeti određeno područje i uništiti sve vojne predmete na koje ste naišli na putu. Prije vas na ekranu vidjet ćete svog lika kojim ćete upravljati pomoću strelica. Čim primijetite metu na zemlji, preletite je i izdahnite plamen. Napadnut će vas razni zrakoplovi i drugi zmajevi. Morat ćete izbjeći njihove napade dok manevrirate u zraku i oboriti sve ove leteće ciljeve.