Thomas the Tank Engine i njegovi prijatelji odlučili su testirati svoje pamćenje. Vi u igrici Thomas and Friends Mix Up pridružit ćete im se u ovoj zabavi. Ispred sebe na ekranu vidjet ćete polje za igru na kojem će karte ležati licem prema dolje. U jednom potezu možete okrenuti bilo koje dvije karte i pogledati slike na njima. Nakon toga će se vratiti u prvobitno stanje i vi ćete ponovno napraviti potez. Vaš zadatak je pronaći dvije identične slike na karticama i otvoriti ih u isto vrijeme. Tako ćete karte na kojima su one prikazane ukloniti s igraćeg polja i za to ćete dobiti bodove u igri Thomas and Friends Mix Up. Kada potpuno očistite polje od karata, možete prijeći na sljedeću razinu igre.